燃料電池電堆的低溫啟動應按如下程序進行：
將燃料電池電堆放置于環境試驗箱中，按照燃料電池供貨商提供的啟動要求，并按下圖連接好氣體管路、雙向開關控制器與啟動用外加直流電源及負載，按試驗要求設置環境試驗箱溫度，
 
低溫存儲之前的關機應按如下程序進行：
a)根據燃料電池電堆的操作要求進行卸載，至開路狀態。
b)調節進氣管道開關，在燃料電池電堆內部溫度測溫點溫度降至零度之前，將燃料氣與氧化劑進氣分別切換為不增濕的干燥惰性氣體，如N2；根據燃料電池電堆供貨商的操作壓力與流量調節惰性氣體進氣壓力與流量，對燃料電池電堆進行吹掃，記錄吹掃壓力、流量與起始時間。
c)根據尾氣排放處濕度傳感器測定的相對濕度控制吹掃時間，當相對濕度達到規定值(10%～20%)時，停止吹掃，記錄吹掃停止時間與濕度。